Ich bin Kleinunternehmer. Kann ich FibuFox trotzdem nutzen?

Ja. Setze unter Firmen-Stammdaten → Steuer das Häkchen bei Kleinunternehmer (§19 UStG, kein USt-Ausweis). Deine Rechnungen enthalten dann keine Umsatzsteuer, sondern den passenden Hinweis zur Kleinunternehmerregelung. Auch die EÜR und der Steuer-Assistent berücksichtigen diese Einstellung.